甘肃有机棉纱与普通棉纱的主要区别在于生产过程、环保标准、品质和成本等方面：
生产过程：
有机棉纱：采用有机种植方法，不使用化学合成农药、化肥、转基因种子等，保证棉花的自然生长环境，减少对土壤和水源的污染。普通棉纱：采用传统种植方法，可能会使用化学合成农药、化肥等，对环境有一定影响。
环保标准：
有机棉纱：符合国际有机农业运动联盟（IFOAM）等机构的有机认证标准，对环境友好。普通棉纱：一般不经过有机认证，可能不符合环保要求。
品质：
有机棉纱：由于不使用化学物质，棉花纤维质量较好，手感柔软，不易起球，穿着舒适。普通棉纱：可能因为使用化学物质，纤维质量相对较差，手感可能较硬，易起球。
成本：
有机棉纱：生产成本较高，因此价格也相对较高。普通棉纱：生产成本较低，价格相对较低。
健康影响：
有机棉纱：由于不使用化学物质，对皮肤刺激较小，更适合敏感肌肤人群。普通棉纱：可能含有残留的化学物质，对皮肤刺激较大。
总的来说，甘肃有机棉纱与普通棉纱在环保、品质和健康方面有较大差异，消费者可以根据自己的需求和预算选择合适的产品。